Dostępne moduły systemu Mago.Net podzielone na obszary funkcjonalne:

Obszar księgowości

• Księgowość
• Środki trwałe
  
• Analizy i kontroling
• Prognozowanie
• Bilans wielooddziałowy

Obszar sprzedaży

• Sprzedaż
• Zamówienia klienta
• Zakupy
• Zamówienia zakupu
• Akwizycja
• Intrastat
• Magic documents
• Łatwy podgląd
  

Obszar logistyki

• Magazyn
• Partie i numery seryjne
• X-gate
• Serwer
  

Obszar produkcji

• Zestawienia
• Konfigurator
• Warianty
• Produkcja podstawowa
• Produkcja
• Planowanie produkcji